1928 yılında İstanbul'da doğdu. İlk ve orta öğrenimini değişik il ve ilçelerde, lise öğrenimini Kabataş Erkek Lisesi'nde yaptı. 1945'te İstanbul Üniversitesi Tıp Fakültesi'ne girdi. 1951'de hekim oldu. 1954 yılında İstanbul Üniversitesi Tıp Fakültesi Psikiyatri Kürsüsü'ne asistan, 1958'de uzman, Psikoz ve Psikonevroz Vakalarında Koku Sinirinin Elektro Stimülasyonu adlı teziyle 1954'te doçent, 1969'da da profesör oldu. 1990-95 yılları arasında İstanbul Üniversitesi Tıp Fakültesi Psikiyatri Anabilim Dalı Başkanlığı yaptı. 1995'te emekli oldu. Bilimsel çalışma, araştırma ve yayınları; gençlik sorunları, ruh sağlığı, davranış bozukluklarının ilaçla tedavisi, ilaç bağımlılığı alanlarında yoğunlaşmıştır. Yirmi kitabı bulunan Köknel'in araştırma, çalışma ve kitaplarıyla ilgili dört de ödülü vardır.